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Un microbiote est l’ensemble des micro-organismes (bactéries, levures, champignons, virus) vivant dans un environnement spécifique. Il existe ainsi un microbiote du sol, un microbiote de l’océan, mais surtout il existe des microbiotes associés au corps humain : microbiote cutané, microbiote vaginal…et le plus étudié, le microbiote intestinal.
Chaque individu a un microbiote intestinal qui lui est propre, constitué d’environ 160 espèces bactériennes différentes.
Les microbiotes jouent un rôle majeur sur notre santé